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Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具基本簡介
Graphpad Prism 是一款優(yōu)秀的統(tǒng)計繪圖軟件，集生物統(tǒng)計、曲線擬合、科研繪圖于一體。軟件專門為科研工作者設(shè)計，可以輕松地進(jìn)行統(tǒng)計分析并繪制統(tǒng)計圖，已被世界知名學(xué)府、科研機(jī)構(gòu)、醫(yī)學(xué)中心和制藥企業(yè)廣泛使用。Graphpad Prism 具有功能實用、操作便捷等特點，自推出以來受到了很多用戶的喜愛，該軟件集生物統(tǒng)計、曲線擬合和科學(xué)繪圖于一體，可以幫助醫(yī)學(xué)人員輕輕松松就可以制作出專業(yè)的醫(yī)學(xué)表。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具軟件科普
非線性回歸是分析數(shù)據(jù)的重要工具，但往往比需要的難度更大。 沒有其他程序能像 Prism 那樣簡化曲線擬合。 事實上，你通?？梢栽谝粋€步驟中適合曲線。 只需從常用方程式的廣泛列表中選擇一個方程式(或輸入您自己的方程式)，Prism 會自動完成其余部分 – 適合曲線，以表格形式顯示結(jié)果，在曲線圖上繪制曲線，并插入未知值。將多個數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)并排放置在有組織的數(shù)據(jù)表上，而 Prism 可以一次將所有的數(shù)據(jù)集合在一起。 您可以分別將相同的模型擬合到每個數(shù)據(jù)集，使用全局非線性回歸在數(shù)據(jù)集之間共享參數(shù)值，或?qū)⒉煌哪Ｐ蛿M合到不同的數(shù)據(jù)集。
麻雀雖小五臟俱全，Prism 也為您提供了許多先進(jìn)的配件選擇。它可以將最佳擬合參數(shù)的置信區(qū)間報告為非對稱范圍(P值相似方法)，它比通常的對稱區(qū)間要精確得多。 它還可以自動插入標(biāo)準(zhǔn)曲線中的未知值(即分析RIA數(shù)據(jù))，使用F檢驗或Akaike信息準(zhǔn)則(AIC)比較兩個方程的擬合，繪制殘差，識別異常值，差異重量數(shù)據(jù)點，測試正常性的殘差等等。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具軟件功能
數(shù)據(jù)組織：
采用結(jié)構(gòu)化、格式化的數(shù)據(jù)表概念，用戶需根據(jù)要創(chuàng)建的圖表或分析類型（如XY圖、柱狀圖、生存曲線等）選擇相應(yīng)的數(shù)據(jù)表格式。
這種設(shè)計使得數(shù)據(jù)組織清晰，直接對應(yīng)實驗的分組和重復(fù)設(shè)計，為后續(xù)統(tǒng)計分析和作圖打下堅實基礎(chǔ)。
統(tǒng)計分析：
內(nèi)建豐富的統(tǒng)計分析方法，包括t檢驗、方差分析、非參數(shù)檢驗、線性回歸、邏輯回歸、生存分析等。
軟件能夠自動計算統(tǒng)計量、P值、置信區(qū)間等，并生成符合規(guī)范的統(tǒng)計結(jié)果表格和圖表。
引導(dǎo)用戶選擇合適的檢驗方法，避免誤用統(tǒng)計，并能自動解釋結(jié)果。
圖表繪制：
提供大量高度可定制的科研圖表模板，如柱狀圖、折線圖、散點圖、箱線圖、生存曲線圖等。
用戶可以自定義圖片的各個細(xì)節(jié)，如坐標(biāo)軸、標(biāo)題、圖例、刻度標(biāo)簽等，以得到漂亮的統(tǒng)計圖。
支持多種格式的圖片輸出，包括高分辨率的TIF格式和EPS格式，滿足發(fā)表文章的各種需要。
結(jié)果整合與輸出：
項目文件包含所有數(shù)據(jù)表、分析結(jié)果、圖表和注釋，方便用戶進(jìn)行項目管理和協(xié)作。
支持將多個圖表、結(jié)果表格、文本注釋組合排列在一頁或多頁上，形成完整的圖表結(jié)果展示頁。
可以導(dǎo)出單張或多張圖表為高分辨率圖片文件，或?qū)⒄麄€布局導(dǎo)出為PDF。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具特色
直觀易用：
界面友好，無需編程基礎(chǔ)，降低學(xué)習(xí)門檻。
工具欄按鈕簡潔明了，一鍵式操作，包含了所有的繪圖和分析功能。
統(tǒng)計嚴(yán)謹(jǐn)：
內(nèi)建豐富的統(tǒng)計分析方法，自動生成符合規(guī)范的統(tǒng)計結(jié)果。
在執(zhí)行統(tǒng)計分析時，軟件會引導(dǎo)用戶選擇合適的檢驗方法，避免誤用統(tǒng)計。
圖表精美：
提供大量高度可定制的科研圖表模板，輸出出版級圖片。
用戶可以根據(jù)自己的需要選擇最適合的圖表類型，以展示數(shù)據(jù)的關(guān)系和趨勢。
數(shù)據(jù)與圖表聯(lián)動：
修改數(shù)據(jù)后，圖表會自動更新，避免重復(fù)勞動。
這種聯(lián)動性使得用戶可以更加高效地進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和可視化。
兼容性好：
支持Windows和Mac操作系統(tǒng)，滿足不同用戶的需求。
支持多種數(shù)據(jù)導(dǎo)出格式，方便與其他軟件（如Word、PPT）進(jìn)行數(shù)據(jù)交互和協(xié)作。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具安裝步驟
1、在華軍軟件園下載這款軟件的壓縮包，解壓后，雙擊exe文件，進(jìn)入安裝界面，點擊browse可以修改默認(rèn)在C盤的安裝位置，建議大家選擇安裝在D盤，然后點擊install
2、軟件正在安裝，我們耐心等待
3、軟件安裝成功，點擊finish即可
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具使用方法
1、數(shù)據(jù)的錄入
打開GraphPad Prism軟件后，軟件會讓操作者選擇數(shù)據(jù)的輸入類型，此時注意選擇“Column”這個選項。如圖2所示：
之后分別輸入兩組變量的值。如圖3所示，實驗組共5個樣本，檢測數(shù)值分別為1，2，3，4和5;對照組也是5個樣本，分別是4，5，6，7和8。也可以在表頭上對數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)識，分別為Experiments和Controls。如果此處不進(jìn)行標(biāo)識，默認(rèn)的組名是Dataset A和Dataset B。
2、結(jié)果的運(yùn)算
結(jié)果錄入完畢后，點擊菜單欄中的Analyze，會出現(xiàn)如圖4所示的界面。注意左側(cè)一定要選中”t tests (and nonparametric tests)”。
點擊圖4中的OK，會進(jìn)入如圖5所示界面。在此界面中，軟件要求作者選擇是否配對(Paired和Unpaired)，并決定選擇參數(shù)檢驗還是非參數(shù)檢驗。所謂參數(shù)檢驗就是指配對t檢驗或獨立樣本t檢驗，而非參數(shù)檢驗則是指Mann-Whitney U檢驗或配對Wilcoxon檢驗。如果選擇參數(shù)檢驗(默認(rèn)兩組數(shù)據(jù)均呈正態(tài)分布)，軟件會讓操作者選擇方差是否齊。
如果方差齊，軟件會選擇t檢驗，如果不齊，軟件推薦Welch法。需要說明的一點是，如果兩組數(shù)據(jù)均呈正太分布，但方差不齊，此時應(yīng)采用校正t檢驗，目前有三種主要的校正t檢驗法：Cochran & Cox法、Satterthwait法和Welch法。GraphPad Prism僅支持Welch法。
如果兩組數(shù)據(jù)不呈正太分布，則應(yīng)該選用非參數(shù)檢驗。非參數(shù)的兩個選項分別是Mann-Whitney U檢驗和Kolmogorov-Smirnov檢驗。一般選擇Mann-Whitney U檢驗。
除了Experimental Design以外，還可以對Optional選項里面的內(nèi)容進(jìn)行修改。如圖6所示。一般建議選擇“Discreptive statistics for each data set”(展示各組數(shù)據(jù)的均數(shù)、中位數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)差、秩和等)選項。在P value一段，系統(tǒng)默認(rèn)為雙尾檢驗，一般建議不要更改。
所有的選項選擇完畢后，點擊OK即可進(jìn)行計算。
3、結(jié)果的解讀
結(jié)果一般分為兩個部分，一是差異是否具有統(tǒng)計學(xué)意義;二是差異有多大。如果研究者選擇了Mann-Whitney U檢驗，則可得到如圖7所示的結(jié)果。
參數(shù)分析結(jié)果的解讀與此類似，只不過多了個F test to compare variances，即方差是否齊。一般認(rèn)為，P值大于0.10才可以認(rèn)為兩組數(shù)據(jù)方差相同(注意：是“大于”，不是“小于”!是“0.10”，不是“0.05”!!!!)。
4、檢驗數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布
可能有的讀者會問GraphPad Prism能否判斷數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布。其實是可以進(jìn)行正態(tài)分布檢驗的。以上述兩組數(shù)據(jù)為例，首先點擊Analyze，然后選擇XY Analysis下面的Column statistics。如圖8所示：
如圖9所示，GraphPad Prism提供了三種檢驗數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布的方法：D’Agootino-Pearson法，Kolmogorov-Smirnov法和Shapiro-Wilk法。針對同一種數(shù)據(jù)，三種方法的計算結(jié)果大同小異。雖然GraphPad Prism不推薦用Kolmogorov-Smirnov法，但根據(jù)筆者經(jīng)驗，在國際上發(fā)表論文時，多采用Kolmogorov-Smirnov法的結(jié)果，可能是因為當(dāng)樣本量太小時，Shapiro-Wilk法和D’Agootino-Pearson法無法給出檢驗結(jié)果。當(dāng)然，也可以三種方法都選擇，綜合判斷數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布。
選擇好統(tǒng)計方法之后點擊OK，就可以得到正態(tài)檢驗的結(jié)果，如圖10所示。需要特別說明的是：在正態(tài)檢驗中，一般認(rèn)為P大于0.10才表述數(shù)據(jù)呈正態(tài)分布(注意：是“大于”，不是“小于”!是0.10，不是“0.05”!!!!)。在本案例中，兩組數(shù)據(jù)的P值均為0.20，因此可以認(rèn)為兩組數(shù)據(jù)均呈正態(tài)分布。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具常見問題
用Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具官方版軟件繪制散點圖及線性分析?
打開Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具官方版，將Y右側(cè)的第一欄選中，點擊create。
分別在X和Group A下方對應(yīng)的空白處輸入組別，并在X、Y下方輸入數(shù)據(jù)。
點擊Graphs下方的Data1，輸出圖片，選擇散點圖，點擊ok。
點擊Analyze，點擊線性回歸(Linear regression)。
點擊ok，彈出如下對話框，繼續(xù)點擊Ok，出現(xiàn)擬合好的直線圖。
繼續(xù)點擊analyze，開始進(jìn)行相關(guān)性分析。將線性回歸改成相關(guān)性(correlation)。
點擊Ok，彈出如下對話框，繼續(xù)點擊ok。在結(jié)果中可以看到散點圖的Pearson r 相關(guān)性以及P value大小。
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Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具更新日志
1：優(yōu)化了性能
2：解決bug問題我們是認(rèn)真的
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